基地在与《云南民族大学学报（哲学社会科学版）》、《民族学报》等刊物加强合作的同时，也通过本身拥有的学术优势和人才优势，积极争取设立自己的学术刊物或集刊，先后出版《人文学刊》、《人文论丛》、《人文边疆》等不定期学术刊物。2008年5月，张桥贵教授主编、中国社会科学出版社出版的《云南跨境民族宗教社会问题研究（之一）》是基地系列研究丛书的第一部，目前该丛书的第二部正在积极筹划出版之中。