其一是对云南边疆跨境民族地区宗教问题、宗教渗透与反渗透问题以及宗教与社会主义社会相适应的理论与实践问题的调查研究，代表性成果主要有张桥贵教授主持的国家社科基金重点项目《云南边疆民族地区多元宗教和谐相处的经验和对策研究》、已经结项的国家社科基金课题最终研究成果《抵御境外敌对势力利用宗教进行渗透的对策研究》，韩军学教授的国家社科基金课题《扩大对外开放与抵御境外宗教渗透》以及《多民族共聚地区宗教现状与社会稳定对策研究》、徐祖祥教授的国家社科基金课题《中越跨境民族宗教生态平衡与和谐边疆建设关系研究》以及国家民委项目《边疆民族地区宗教与社会主义社会相适应调查研究》、孙浩然副教授主持的云南省社科基金青年项目《宗教渗透与云南边疆民族地区意识形态安全研究》以及云南省社科研究基地项目《云南跨境民族地区宗教与民族团结关系研究》等，此外还有大量此相关论文或论著。

其二是对云南边疆跨境民族地区毒品、艾滋病两大突出社会问题和密切相关的社会和谐稳定问题、以及跨国人口流动问题的调查研究，较具代表性的主要有鲁刚教授主持完成的《边疆民族地区构建社会主义和谐社会进程中的社会稳定问题调查研究》国家社科基金研究课题最终研究成果，张金鹏教授的国家社科基金在研课题《边疆民族地区艾滋病的防治与社会控制》，鲁刚教授的省社科基地在研课题《云南跨境民族毒品问题调查研究》，以及杨国才教授主编出版的《多学科视野下的艾滋病应对》等相关论著论文和课题成果。

其三是对云南边疆民族地区社会发展变迁、社区建设和贫困等问题的调查研究，主要以张金鹏教授的《构建社会主义和谐社会条件下的民族社区发展研究》、罗阳教授的《云南西双版纳傣族社区与发展》等论著为代表，同时还有俞茹研究员的《金沙江、澜沧江、怒江流域少数民族社区社会结构变迁与发展问题研究》（国家社科基金课题）、李晓莉教授的《云南彝族易地扶贫搬迁与文化适应研究》（云南省哲学社会科学研究基地项目）、马永清副教授的《云南农村社区服务体系建设研究》（云南省社科基金项目）、杨国才教授的《云南金平苦聪人社会变迁研究》、《云南少数民族发展与构建和谐社会》，等省部级研究课题与相关论文。

其四是对云南边疆民族地区妇女问题和女性学构建的调查研究与探讨，代表作主要有杨国才教授主编的《女性学学科建设与少数民族妇女问题研究》、《女性学的本土化尝试——云南少数民族女性与发展》，李晓莉教授的《云南直苴彝族婚姻家庭研究》等论著及相关论文，以及杨国才教授的国家社科基金在研课题《女性社会学视野下的少数民族妇女流动》等等。

上列四类科研成果，尽管在各研究方向的成员之间略有交叉，但均呈现出相对的集约性特征和以“边疆跨境民族”作为主要研究对象的鲜明特色，是本基地学科的代表性研究成果。