一是学术团队建设尤其是人才引进不够理想，顶尖级高层次人才的实际引进尚待突破；二是优秀教学成果获奖有待突破；三是高水平的教材有待突破；四是基地创办的学术刊物和集刊的影响力有待进一步提高；五是简报服务基地建设的功能还有待增强；六是基地网站建设还有待加强。

云南地处祖国西南边疆、经济文化发展水平相对滞后，对高层次顶尖级人才吸引力不强，社会学属改革开放以后才恢复重建的新兴学科，目前高层次顶尖级人才在全国范围内均属稀缺资源；与学科所设方向特别是在以宗教问题和毒品、艾滋病、边疆稳定、国家安全等作为主要研究对象的系列研究成果中，因多涉及到国家机密和敏感问题而在公开发表时造成较大困难；至于优秀教学成果获奖数量未能达标，则主要是主观努力不够和申报机会把握不准两大人为因素所致。教材和学术刊物、学术集刊编纂出版、简报编辑等工作相对滞后，主要原因是精力过多投放在课题申报、课题研究、论文撰写以及专著撰写等方面，致使基地在基础设施和队伍建设过硬、经费投入合理、基地管理科学、科研成果突出、人才培养突出、学术交流访问突出、整体成绩优秀的情况下，还存在个别薄弱环节。